研究灵魂不灭，我们参考材料的主要来源，即非科学，亦非哲学。科学只能从物质界有限的观点来考察这些事，而且只能接受由感官而来的见证，因此不能解决根本问题。论到赞同或反对灵魂不灭都没有确实的把握。许多承认基督教信仰的科学家，声称他们相信灵魂不灭，然而还有其余未信基督教的科学家，往往怀疑，甚而否认人死后灵魂仍存。
无人能以科学的试验或算学上方式来证明灵魂不灭，正如人不能以此方法来证明神之存在一样。当人们要求如此证据的时候，他们是茫然行事，并未仔细思索。所谓理性上的证明，或许给予赞成神存在或灵魂不灭的假说，而且往往接受此证据的人，是蒙属灵光照的人。但是这些证明并非绝对证明，因此不足以令未重生的人相信。
缘故是这个：灵界的事实是不能以感官来接受的，必须以属灵的眼光来分辨。党感官意图处理属灵之事的时候，那它们就是越过界线，侵入无权发言的范围中。理智也是“属血气之人”的一部分，既承受反道德与属灵之事的偏见为堕落的结果，所以不能不以感官来解释灵界的现实性。从各方面看来，灵魂不灭的证据必须是内在的，主观的。属世的，未重生的人不得窥其底蕴；惟有敬虔，属灵的人方能看见。过一个有灵魂不灭价值的生活必需品的人。不难相信灵魂不灭，他对灵魂不灭的信念与他在恩典中的长进而长进。
关于灵魂不灭，我们不能从物质科学得到什么知识，因为物质科学只论到物质世界的生活与现象。它对灵魂不灭所能给予的唯一回答，就是一个深奥的沉默。它论到眼不可见的灵界，毫无所知，也无从摸索。物质科学若不凭眼见的证据，往往不承认灵魂为一与身体分立的生命原则。但这要求是太过分。身体与灵魂既各属于不同的范围，所以单在肉体中，求眼可见的作为灵魂的证据，颇不合理。这正如一个瞎眼的人，否认没有光一样，因为他简单的理由是因为他不能看见光。难题并非在乎光，乃在乎他没有正确感官的事实。真实，无偏见的科学只能说它不能证明，也不能反证（否认）属灵的事，至于论到属灵的事，也必须以未可证实的假说来论。
哲学也不能比科学有什么帮助。哲学也必须在人的心思限度内活动，它也如科学一样，除了世界本身以外，并无报导的来源。然而神学乃是对神藉着那部灵感的圣经，来解释世界的由来，目的与命运，哲学是人的解释，只限于人类的心思与物质世界的范围以内。没有哲学家能够解决宇宙之迷，也没有任何人能发现罪的救法。
在过去反对灵魂不灭的，根本是由唯物论的哲学兴起的。虽然大多数否认灵魂不灭的人，与哲学并没有正式的关系，也不明白哲学，但以上的说法向来是真实的。如果我们拒绝神的存在，以原始单独存在的物质为前提说起，那么人为身体与灵魂联合的二元观念必得放弃，这是十分明显的。这样说来，理智的活动不过成为大脑的功能，大脑被毁坏的时候，一切活动就中止了。因此，一个重要的问题就来了，“到底人是什么？”人是原初按着神的形像造的，有身体灵魂并为不朽的将来而预定的呢？人还是有机进化的产物，以极原始的形式而有的，在此形式中存在并逐渐发展到如今有自我意识，有理性的位格呢？
我们对这些问题的回答，要多牛决定我们关于灵魂不灭的观点，唯物论哲学用以说明人思想过程的现象的比喻，就是发电机所生的电波：——发电机发生电波，所以大脑生出思想；发电机停止，电波亦随之中止，照样身体死了，灵魂也归于无有。如果我们接受唯物论哲学的前题并拒绝神为创造者，为第一原因，我们也必须接受它的结论，就是说人是物质力的产品，他所以到达现今高尚的地步，是凭藉进化的步骤而来的。
究竟我们所说有机的进化是什么意思呢？或许最合乎科学的定义，就是地质学家拉康特（LeConte）所提出的。他说：“进化是（１）继续进行的，（２）按照某项原则，（３）藉其固有能力的改变。”
为今日多人所主张的进化论乃是一种哲学，并非科学的理论，此点无庸赘言。科学论到事实，论到我们所“知道”的，就是能在化学试验室中可以证明的。哲学包括的范围较广，它是论到理论以及形而上的事物。科学不能证明从无生物会产生出来生命，也不能证明由一种物种而演化到另一物种，也不能证明人由于极原始的情况而进入他现今的状态。穆尔（LouisT.More）说，“论到思想的进化，从海黏土到变形虫，与从变形虫到有自我意识的人，都毫无意义；那是无思想之人的简易解释……让生物学家在他的试验室里，从无生物中弄出一个生命细胞来。他若是不能从死物中造出活的细胞来，他就和亚里斯多德所说的一样，尘土会生出蚤子来。”
为了分晰我们目前的难题，我们要引证中央大学名誉教授麦马伦博士（Dr.C.B.McMullen）的话。麦氏本人系哲学家又为特别有力的，“进化的论理”一书的著者。在其最近所著尚未出版的原稿中，他说：
“我们上那里去找我们最关心之难题的适当解答？当然不能在互相冲突的哲学中去找，这已经试验很久了。往往这些部门的哲学都是扩展到自己的范围以外。
“论到科学家所主张的自然主义哲学也是这样。论理学已把道德律减低至以便利主义为根基的“操行模范”。新派的神学把超自然从圣经中逐渐排除。
“唯物主义的科学家把通常所主张的见解——这些见解都经新派的神学家整个的，或部分的给发扬光大——归纳成为一种公式：我们的世界是由星云状的物质开始的；及时，在化学的活动中发现了自体，及时，在植物的生命中浮出，又有了有意识的动物，又进化为有自我意识的人类。简言之，原始的物质为物质界的力量所支配，经过相当时期得到足以产生出来摩天楼与原子弹的智慧。
“在过去与未来的唯物论哲学中，根本没有超自然的地位。人是完全独立的。在宇宙的进程中，他简直是一个偶发事件（是突如其来的）。唯物主义不知自由为何物；没有自由当然没有责任。在唯物论的宇宙中，是非并没有道德上的意义。取而代之的是方便政策（达目的不择手段）。良心不过是自然的把戏，用以促进社会生活，救人得免互相杀戮。”
进化论哲学兴起不可避免的结果，就是道德的与属灵的衰微。吴德（WilliamH.Wood）在其所著“科学的宗教”一书中说：“反对进化论及其虔信着，特别是在教会中，乃是一个严重的事体。进化论不仅废除信仰，而且也废除所信仰的神。假设的“神”似乎是不必需的。启示被否认，圣经的权威被摈斥，神迹遭受嘲弄，人从圣经所给高尚的地位上被驱逐下来仅仅算作一个高等动物，自然主义成为所接纳的哲学，自由成为一种聪明的欺骗，不灭只应用在肉体的元素上。”
最近所发现愚弄人的毕特当头骨（Piltdownskull）就说明了上述诸点，这个头骨为过去四十年的进化论科学家所接受，认为是十万年之久的历史前人类的遗物。这些头骨是在近英格兰南部海岸的深谷中发现的，又在伦敦大英博物院陈列，认为进化论的基本证据之一。但博物院当局于最近出版一小册（一九五五年一月），是经十二位专家执笔，声称该头骨的颚骨（下巴骨）与一些牙齿是属于未长成之猿猴的，是后来经过修理才象人的骨头，据说连那些与头骨一同发现的石器械都是伪造的。