一八三二年二月间，他开始阅读法兰克的传记，法氏在一六九六年开始在德国哈勒创办当时世界最大的贫儿院。他相信神，神就一直丰富地供应他。於是穆勒也有负担从事这种工作。因为当时这些贫苦儿童，没有机会受教育，每星期要在工厂，煤矿场工作六天，每天从早上六时工作到晚上八时。有时一些孤儿从工厂中逃走，露宿街头靠乞讨，偷窃维生。
一八三三年六月十二日，穆勒心里内燃的火开始冒烟，他想何不每晨八时左右招集街上可怜的孩子，给他们一些面包充饥，而後教他们念，或给他们听一小时半的圣经呢？将来这个计划也可实行在成人和老弱身上。他马上开始喂养三四十个小孩，他相信当数目加增之时，主的供应也必增加。他向克莱克吐露他的心情，得到指示租下一所可容一百五十人的房屋，每年租金只十先令。同时也有一位年老的弟兄乐意担任教职。可惜这个计划未能完全实行，因为吃面包的人愈来愈多，噪杂的情形引起邻舍的不满，只得暂时放弃，可是这种意念和目的始终不忘。
一八三五年十一月二十日，他在一位姊妹家里喝茶，又看见了那本法兰克的传记。他想作这工作已经很久了，他无意仿效，只觉得有同样的引导而已。这种印象长成信念，变成决心，化成行动。他觉得应当往前进一步，因为他已经得到印证，神乐意供给一切需要。他时常省察自己的心，惟恐有什么隐藏不正当的动机在内。他向克莱克倾吐他的心情，仰望神藉著他的弟兄来纠正一切，然而克莱克非常鼓励他。经过更多的祷告，三日後他得到诗篇八十一篇十节的话：「你要大大张口，我就给你充满”，大受感动。他在十二月二日发出通知，准备下周召集弟兄们，将这件开办孤儿院的事摆在他们面前，一同寻求神的旨意。
一八三五年正月十六日，穆勒发表一篇说明，其中这样说：“时常有实例带到我跟前，证明神的儿女在今日有一种特别的需要，就是他们的信心需要得到坚固。我的灵渴慕能作这个器皿，不只从神的话里证明神愿意并且实在能够帮助一切倚靠他的人，更能用事实来证明，神在今日还是不改变的。我很晓得，神的话应当足够使我们来倚靠他。因著恩典，的确够我相信。但我还是觉得，我应当给我的弟兄一臂之助，若有明显的凭据，证明主那永不改变的信实，当能大大稳定他们倚靠神的手。因为我不能忘怀藉著依靠神我的心灵所得著的大祝福。当我看到主如何带领他的仆人法兰克，他单倚靠永活的神，建立了极大的孤儿院，我也曾亲眼好几次见过这些伟大的建筑物，所以我感觉自己必须在亲身蒙恩的点上，来作神教会的仆役；我所蒙的恩，就是能够照著神的话来相信并完全倚靠他。许多我所熟识的信徒，因著不能倚靠主，而心思烦扰，良心不安。这些事实引起我心灵的负担，神就藉此在我心里唤起一个愿望，要在教会和世界面前，摆上一个确据，就是主始终没有改变。我认为最好的路，莫过於设立一个孤儿院。假如我这个赤贫的人，单凭祷告和相信，不向任何人开口，得到供应来建设并维持一个孤儿院，这件事就能在主的祝福之下，坚固神儿女的信心，同时也能把属灵的真实荐於未信之人的良心。这是设立孤儿院的基本原因。我衷心愿意被神使用，来看顾失丧父母的可怜孩子，在神的帮助之下，供给他们今生的需要；我尤其渴望被神所用，培植这些可爱的孤儿，使他们能够敬畏主；但是工作的首先和主要目的，还是盼望神能因此得到高举。这些在我看顾下的孤儿，他们一切的供应，都是从祷告和相信得来的，无论是我或是我的同工，从不向人开口，由此可见，神依然信实可靠，仍旧垂听祷告。所以三个设立孤儿院的原因，可以说是（一）神能因此得到荣耀。神既然乐意供给我一切需要，可见倚靠他的必不落空，这样神儿女的信心就能得到坚固。（二）这些无父无母的孩子得到属灵的帮助。（三）他们可以得到属世的益处。
十二月五日，到今天为止，我没有为孤儿院所需的金钱人力而祈祷。我现在把诗篇八十一篇十节的这段经文引用在孤儿院的事上；我跪下来，求主赐我房屋和一千镑银，以及适当的人手来照顾孩子。