研究靈魂不滅，我們參考材料的主要來源，即非科學，亦非哲學。科學只能從物質界有限的觀點來考察這些事，而且只能接受由感官而來的見證，因此不能解決根本問題。論到贊同或反對靈魂不滅都沒有確實的把握。許多承認基督教信仰的科學家，聲稱他們相信靈魂不滅，然而還有其余未信基督教的科學家，往往懷疑，甚而否認人死後靈魂仍存。
無人能以科學的試驗或算學上方式來證明靈魂不滅，正如人不能以此方法來證明神之存在一樣。當人們要求如此證據的時候，他們是茫然行事，並未仔細思索。所謂理性上的證明，或許給予贊成神存在或靈魂不滅的假說，而且往往接受此證據的人，是蒙屬靈光照的人。但是這些證明並非絕對證明，因此不足以令未重生的人相信。
緣故是這個︰靈界的事實是不能以感官來接受的，必須以屬靈的眼光來分辨。黨感官意圖處理屬靈之事的時候，那它們就是越過界線，侵入無權發言的範圍中。理智也是“屬血氣之人”的一部分，既承受反道德與屬靈之事的偏見為墮落的結果，所以不能不以感官來解釋靈界的現實性。從各方面看來，靈魂不滅的證據必須是內在的，主觀的。屬世的，未重生的人不得窺其底蘊；惟有敬虔，屬靈的人方能看見。過一個有靈魂不滅價值的生活必需品的人。不難相信靈魂不滅，他對靈魂不滅的信念與他在恩典中的長進而長進。
關于靈魂不滅，我們不能從物質科學得到什麼知識，因為物質科學只論到物質世界的生活與現象。它對靈魂不滅所能給予的唯一回答，就是一個深奧的沉默。它論到眼不可見的靈界，毫無所知，也無從摸索。物質科學若不憑眼見的證據，往往不承認靈魂為一與身體分立的生命原則。但這要求是太過分。身體與靈魂既各屬于不同的範圍，所以單在肉體中，求眼可見的作為靈魂的證據，頗不合理。這正如一個瞎眼的人，否認沒有光一樣，因為他簡單的理由是因為他不能看見光。難題並非在乎光，乃在乎他沒有正確感官的事實。真實，無偏見的科學只能說它不能證明，也不能反證（否認）屬靈的事，至于論到屬靈的事，也必須以未可證實的假說來論。
哲學也不能比科學有什麼幫助。哲學也必須在人的心思限度內活動，它也如科學一樣，除了世界本身以外，並無報導的來源。然而神學乃是對神藉著那部靈感的聖經，來解釋世界的由來，目的與命運，哲學是人的解釋，只限于人類的心思與物質世界的範圍以內。沒有哲學家能夠解決宇宙之迷，也沒有任何人能發現罪的救法。
在過去反對靈魂不滅的，根本是由唯物論的哲學興起的。雖然大多數否認靈魂不滅的人，與哲學並沒有正式的關系，也不明白哲學，但以上的說法向來是真實的。如果我們拒絕神的存在，以原始單獨存在的物質為前提說起，那麼人為身體與靈魂聯合的二元觀念必得放棄，這是十分明顯的。這樣說來，理智的活動不過成為大腦的功能，大腦被毀壞的時候，一切活動就中止了。因此，一個重要的問題就來了，“到底人是什麼？”人是原初按著神的形像造的，有身體靈魂並為不朽的將來而預定的呢？人還是有機進化的產物，以極原始的形式而有的，在此形式中存在並逐漸發展到如今有自我意識，有理性的位格呢？
我們對這些問題的回答，要多牛決定我們關于靈魂不滅的觀點，唯物論哲學用以說明人思想過程的現象的比喻，就是發電機所生的電波︰——發電機發生電波，所以大腦生出思想；發電機停止，電波亦隨之中止，照樣身體死了，靈魂也歸于無有。如果我們接受唯物論哲學的前題並拒絕神為創造者，為第一原因，我們也必須接受它的結論，就是說人是物質力的產品，他所以到達現今高尚的地步，是憑藉進化的步驟而來的。
究竟我們所說有機的進化是什麼意思呢？或許最合乎科學的定義，就是地質學家拉康特（LeConte）所提出的。他說︰“進化是（１）繼續進行的，（２）按照某項原則，（３）藉其固有能力的改變。”
為今日多人所主張的進化論乃是一種哲學，並非科學的理論，此點無庸贅言。科學論到事實，論到我們所“知道”的，就是能在化學試驗室中可以證明的。哲學包括的範圍較廣，它是論到理論以及形而上的事物。科學不能證明從無生物會產生出來生命，也不能證明由一種物種而演化到另一物種，也不能證明人由于極原始的情況而進入他現今的狀態。穆爾（LouisT.More）說，“論到思想的進化，從海黏土到變形蟲，與從變形蟲到有自我意識的人，都毫無意義；那是無思想之人的簡易解釋……讓生物學家在他的試驗室里，從無生物中弄出一個生命細胞來。他若是不能從死物中造出活的細胞來，他就和亞里斯多德所說的一樣，塵土會生出蚤子來。”
為了分晰我們目前的難題，我們要引證中央大學名譽教授麥馬倫博士（Dr.C.B.McMullen）的話。麥氏本人系哲學家又為特別有力的，“進化的論理”一書的著者。在其最近所著尚未出版的原稿中，他說︰
“我們上那里去找我們最關心之難題的適當解答？當然不能在互相沖突的哲學中去找，這已經試驗很久了。往往這些部門的哲學都是擴展到自己的範圍以外。
“論到科學家所主張的自然主義哲學也是這樣。論理學已把道德律減低至以便利主義為根基的“操行模範”。新派的神學把超自然從聖經中逐漸排除。
“唯物主義的科學家把通常所主張的見解——這些見解都經新派的神學家整個的，或部分的給發揚光大——歸納成為一種公式︰我們的世界是由星雲狀的物質開始的；及時，在化學的活動中發現了自體，及時，在植物的生命中浮出，又有了有意識的動物，又進化為有自我意識的人類。簡言之，原始的物質為物質界的力量所支配，經過相當時期得到足以產生出來摩天樓與原子彈的智慧。
“在過去與未來的唯物論哲學中，根本沒有超自然的地位。人是完全獨立的。在宇宙的進程中，他簡直是一個偶發事件（是突如其來的）。唯物主義不知自由為何物；沒有自由當然沒有責任。在唯物論的宇宙中，是非並沒有道德上的意義。取而代之的是方便政策（達目的不擇手段）。良心不過是自然的把戲，用以促進社會生活，救人得免互相殺戮。”
進化論哲學興起不可避免的結果，就是道德的與屬靈的衰微。吳德（WilliamH.Wood）在其所著“科學的宗教”一書中說︰“反對進化論及其虔信著，特別是在教會中，乃是一個嚴重的事體。進化論不僅廢除信仰，而且也廢除所信仰的神。假設的“神”似乎是不必需的。啟示被否認，聖經的權威被擯斥，神跡遭受嘲弄，人從聖經所給高尚的地位上被驅逐下來僅僅算作一個高等動物，自然主義成為所接納的哲學，自由成為一種聰明的欺騙，不滅只應用在肉體的元素上。”
最近所發現愚弄人的畢特當頭骨（Piltdownskull）就說明了上述諸點，這個頭骨為過去四十年的進化論科學家所接受，認為是十萬年之久的歷史前人類的遺物。這些頭骨是在近英格蘭南部海岸的深谷中發現的，又在倫敦大英博物院陳列，認為進化論的基本證據之一。但博物院當局于最近出版一小冊（一九五五年一月），是經十二位專家執筆，聲稱該頭骨的顎骨（下巴骨）與一些牙齒是屬于未長成之猿猴的，是後來經過修理才象人的骨頭，據說連那些與頭骨一同發現的石器械都是偽造的。