聖靈的運行有幾樣是特別顯著的，聖經也給以特別的名稱，都是聖靈非常重要的工作，應當認識和追求得著。人常對此有不同的解釋和經歷，雖然經歷和講解能有所不同，但基本的真理和原則不能彼此沖突，互相抵觸。我們還要以聖經的教導為依據，並參照聖徒的經歷，盼望不至陷入偏羞和錯誤之中。
一、聖靈的居住
聖靈在舊約時期雖然也與人同在，（創四一38；民廿七18；但四8、18，五11、14）但不是固定的和永久的，因為可能離開和收回。（創六3；撒上十六14；士十六20；詩五一11）但新約因主耶穌的祈求，神所賜的保惠師，卻不再離開，乃永遠同在直到得贖的日子。（約十四16；弗四30）這是指著聖靈在人信而歸主的時候來住在人里面說的。（約十六17；林前六19；約壹二27；林後一27）這是應當在信的時候就得到的。（徒二38，十九2；加三2、14，四6；弗一13）
如果一個人沒有基督的靈，他就不是屬基督的。（羅八9、11）凡是神的兒女，必有神兒子的靈進入他的心，叫他呼叫阿爸父。這樣，聖靈才能和我們的靈同證我們是神的兒女。（加四6；羅八14-16）凡沒有聖靈的人，就不是重生得救的人。可能因為他們沒有真的悔改和相信，真正的信仰是信耶穌是基督，是神的兒子，並信神叫他從死里復活。（約廿31；羅十9）那也就是相信純正的福音，即基督照聖經所說為我們的罪死了，而且埋葬了，又照聖經所說第三天復活了。（林前十五1-4）真為赦罪而信，接受耶穌為救主，就必定要悔改和受洗。（路廿四47；徒二38，三19，五31，八12，十一18，十六31-34，十七30，廿21）沒有悔改的心不能得到赦免，受洗是相信的具體表示，這與受聖靈都有關系。（徒十九2-3、5-6）可能當時未得機會，也要補受洗。（徒十44-48）可能許多稱為基督徒的卻未真悔改相信，所以尚未得到聖靈。
基督應許保惠師來住在門徒的心中，（約十四16）當主復活的那天，他向門徒吹氣，叫他們受聖靈，就應驗了主的應許。這關系他們生命的改變，他們再沒有紛爭，而能同心禱告。（徒一14）直到五旬節得到父所應許的聖靈的澆灌，這是澆灌在他們身上，與聖靈居住在他們里面有所不同。“里面”是為得生命，“外面”是為得能力。路加與約翰都講到聖靈的工作，路加講到“外面”的能，約翰講到“里面”的生命。許多人只注重外面靈顯著的工作，如聖靈的澆灌、恩賜、能力等，而不注重聖靈在人里的運行是不行的。因為聖靈與信徒同在，主要在人的里面（約十四16-17）。聖靈的感動、引導、光照、啟示等都是神在我們心里運行。（腓二13；帖後三5；加一15；弗一17-18）恩膏的教訓也是在我們心里，（約壹二27）有人盼望肉體的耳朵從外面听見聲音是不對的，那容易陷入欺騙和錯誤之中，乃是我們里面有聖靈的感動和指教，有時如同說話一樣，很清楚，有時只是一種感覺叫我們明白聖靈的意思。如果只注重外面一時聖靈的顯現，而忽略里面經常聖靈的工作，這樣，靈性得不到更深造就，生命也不會更豐盛。但也需要聖靈在外面的工作，從我們身上彰顯出來。
二、聖靈的澆灌
神在舊約曾應許將他的靈澆灌下來。（賽卅二15，四四3；結卅九29；亞十二10；箴一23）在五旬節的時候，按彼得的講解，是得到了應驗，（徒二15-21、33）未後的日子，還要在以色列人身上得應驗，這里所提到的澆灌是指著如降雨一樣，聖靈從上面傾倒下來，是同時普遍地臨到許多人，除了在五旬節和末後的日子，猶如秋雨春雨的大澆灌以外，還能有時雨，指在不同時候，澆灌不同的人。教會歷史上曾有多次看到聖靈的澆灌，在一個時期先從一個地方，以後延到別的地方，同時很多人得到聖靈的澆灌，教會得到大復興，許多罪人悔改，大有能力地為主作見證，聖靈澆灌的地方猶如詩篇六十五篇所說，屬靈光景大大改變。（詩六五8-13）
在聖靈大澆灌的時期中各人得到澆灌非常容易，（徒十44；多三6；羅五5）得到的人如同澆灌的園子一樣，又象水流不絕的泉源。不但得到滋潤，也能結果不止。（賽五八11；耶卅一12）在我們這個時代，教會工人和信徒都有極大的需要來得到聖靈的澆灌，千萬的罪人需要悔改，很多的信徒心靈枯干，多少的傳道人沒有能力，教會的光景更是荒涼可憐，只有聖靈的澆灌才能使這一切有改變，象五旬節的時候一樣，在末後的日子還要有更大的澆灌。（徒二16-21）
聖靈的大澆灌的結果是使人外面被聖靈浸透，里面被聖靈充滿，與靈界發生了密切關系，兒女們要說預言，少年人要作異夢，老年人要見異象（珥二28-31）不過也有假的異夢異象不可都信。（徒五7；申十三1、5；耶廿三25、27；亞十2；賽廿九7；耶十四14，廿三16；哀二14；結十三7、9、22；彌三6；亞十三4）我們從聖經見到約瑟、但以理、彼得、保羅等並不是常有異象、異夢，一生不過幾次。那些時常作夢、見異象的多半是不可靠的。而且用以代替聖經真理，隨便指示別人該作什麼，都是不對的。但願追求聖靈澆灌的，不要陷入錯誤、假冒之中，不要被迷惑、受欺騙。有人以為得到了聖靈的澆灌，大哭、大笑不止，是沒有根據的。或每逢禱告就要大哭、大笑、也是很有問題的。有的更狂歡跳舞，以及其他沒有節制，不合聖徒體統的混亂現象，都不合真理。因為神不是叫人混亂，乃是叫人安靜。（林前十四32-32；加五23）人以為得到聖靈總是喜樂的，卻沒有想到也可能心中甚苦，靈性忿激，憂悶而坐，啞口無言的。（結三14-15、26）我們不能限制聖靈的彰顯，但也不能容讓肉體的混亂、狂放。
三、聖靈的洗
施洗約翰曾說到，基督“要用聖靈與火給你們施洗”。（太三一；可一8；路三16；約一33）主耶穌在升天前對門徒說︰“要等候父所應許的…不多幾日，你們要受聖靈的洗。”（徒一4-5）這顯然應驗在五旬節的時候，這時門徒都聚集在一處，“忽然從天上有大響聲下來，好象一陣大風吹過，充滿了他們所坐的屋子，又有舌頭如火焰出來，分開落在他們頭上，他們就都被聖靈充滿。”（徒二1-4）
在主耶穌復活的那天晚上，和門徒在一起的時候，他曾向他們吹了一口氣說︰“你們受聖靈。”（約十二22）那不能說只是一個表號，而無實際，應當認為那天門徒是受了聖靈，可是卻沒有受聖靈的洗，那是要等候到五旬節應驗的，所以復活那天所受的，乃是聖靈住在里面，如同氣一樣，是生命之氣，關乎在重生方面，如彼得書上說，借著基督耶穌從死里復活，重生了我們。（彼前一3）也沒有說門徒那天外面有什麼現象和大的改變，好象外面並無人知道，未引人注意。
但在五旬節時，門徒是受了聖靈的洗，那時有大風吹過，有火焰舌落在他們頭上，他們如同浸在聖靈里，被聖靈所包圍，也被聖靈充滿。聖靈的洗，不是指聖靈進入人的里面，而是臨到人的身上，是人浸入聖靈里，象被聖靈洗過一樣的，目的是叫人活在聖靈里。不過同時也能被聖靈充滿。
再一處提到聖靈的洗，是說我們︰“都從一位聖靈受洗，成了一個身體，飲于一位聖靈。”（林前十二13；弗四5）這一處聖經，上文講到聖靈的各種恩賜，下文講到肢體的相互功用，中間題到受聖靈的洗，才成為一個身體，得到不同的恩賜，發揮肢體的功用。對于有的教會，有的人是對的，在信的時候就能得到。可是對在撒瑪利亞和以弗所的信徒就不是在這時，他們是在信主以後才得到的。（徒八12、16，十九2、5、6）
受聖靈的洗現在不象五旬節前需要等候一定的日子，只要真正悔改，奉主的名受洗，罪得赦免，就可以得到。（徒二15-17，九17，十九6）按手是代表基督的施洗和教會的交通。但並非是絕對的，因五旬節和在哥尼流家中就沒有按手，是主自己和聖靈直接作的。
至于為人按手的人，必須是主所揀選打發的人，自己應先有聖靈的充滿和能力，才可分給別人。（徒八14，九17；羅一11）急促為人按手是要避免的。（提前五22）但有聖靈的同在，卻借著按手能醫治病人，分給恩賜，使人蒙福。（申卅四9；可十16，六5、7，十六18；徒六6，八17；提前四14；提後一6）
四、聖靈充滿
每一個信徒都有聖靈在里面，但不一定都被聖靈充滿了。（弗五18）每一個受聖靈洗的信徒，也不一定同時都被聖靈充滿。雖然在五旬節的時候是如此，（徒一5，二4）在哥尼流家中，提到聖靈降在他們身上，是受了聖靈的洗，卻未說他們被聖靈充滿。（徒十44，十一16）一般來說，在受聖靈的同時，可被聖靈充滿，但非一定如此，聖靈的洗是一次，聖靈充滿可能多次。就如彼得、司提反和保羅都曾多次被聖靈充滿。（徒二4，四8，六3，七55，九17，十三9）卻未提一個人多次受聖靈的洗，我們是要浸于一位聖靈，也要飲于一位聖靈，（林前十二13）浸不能代表飲，飲也不等于浸。
聖靈充滿是從里面充滿到外面，與信徒屬靈的生命和工作都有關系。聖靈充滿該有智慧、信心、喜樂、能力、恩賜為主作見證。（徒二4，四8、31，六5、10；徒七55，十三9-11）有時也看到異象，說預言行神跡。（路一67；徒七55，十三9-11）但聖靈充滿最重要和經常的表現和標志是生命大有改變，軟弱變為剛強，不義成為聖潔，失敗轉為得勝，並結出聖靈的果子來。生活上有了新的內容，不再是世俗的交往，肉體的娛樂，而是用詩章、頌詞、靈歌、彼此對說，口唱心和的贊美主。（弗五18-20；西三16-17）並且越覺越被那充滿萬有者所充滿，且流出活水江河，使別人也得到滿足，受聖靈的洗沒有很多條件，（徒二38，十九2；加三2、5），但要得到聖靈充滿有些條件，雖然不是絕對的，但多半是必要的。
（一）渴了︰（約七37）肉體情欲的渴，盼望從世界里得到滿足，那不是屬靈的饑渴。但當人心靈感到渴了時候，才會到主的面前來，尋求活水，那只有聖靈才能解人靈里的饑渴，渴的越深、得著就越近了。
（二）祈求︰一切屬靈的恩典和好處是從祈求來的。因為祈求的就得著，得不著是因為不求。（太七7；雅四2）主耶穌說︰“何況天父豈不更將聖靈賜給求他的人麼。”（路十一13）“你要大大張口，我就給你充滿。”（詩八一10）
（三）倒空︰徹底認罪悔改，除去一切污穢不義，是絕對必需的。器皿里盛滿了許多別的東西，聖靈不能充滿，應當預備空器皿來盛油（王下四3）倒空的越徹底，充滿就越豐盛。
（四）奉獻︰求聖靈充滿的目的，不是要利用聖靈，乃是要被聖靈使用，目的不對是不行的，所以必須有一顆奉獻的心，將自己完全放在祭壇上。（羅十二1）經過各各他，才到五旬節，先約但河，才看到靈鴿，靈感加倍多。（太三16；王下二9）
（五）順從︰神要將聖靈賜給順從他的人，（徒五32）可能神有所要求，指示和命令，也可能神要剝奪，打擊，看是否甘心順服，若肯甘心听從順服，就能得到聖靈充滿。
（六）等候︰五旬節前，門徒有一段等候時期（路廿四49；徒一4-5、12-14）今天不需等候一個特別的日子，但在神面前卻應當有一個等候的態度。為著預備我們的心，等多少時候不一定，神看為夠了，就必賜下聖靈來。
（七）相信︰所有的禱告都需要信心，主耶穌說“信他的人要受聖靈。”（約七37-38）不要以為神不願賜給，聖靈不肯充滿，乃當相信神願意賜給，聖靈必要充滿我們，用信心等候接受。
我們不是只求一次一時被聖靈充滿，乃是要多次，時時被聖靈充滿，並要作一個滿有聖靈的人。（徒六3、5，十一24）
五、聖靈的恩賜
在聖靈的洗和聖靈充滿的同時，也能得到聖靈的恩賜，但並不是一定的。一般說來，聖靈不會空手來臨，總要帶給恩賜同來分賜給人，所給的恩賜不是同樣的。因為恩賜原有分別，而且是聖靈隨己意分給各人的。（林前十二4-11）這里題到聖靈的九樣恩賜，多指特異的恩賜，就如智慧的言語和知識的言語、信心和醫病的恩賜，行異能和作先知，辨別諸靈和說方言這以及翻方言。
這些恩賜可以求，但不可強求，其中更要羨慕的是作先知講道，比說方言更能造就教會。所以保羅在教會中寧可用悟性說五句教導人的話而強如說萬句方言。（林前十四1-19）說方言乃列為末後的恩賜，而且也不都是說方言的。（林前十二10、28-29）即或能說萬人方言，並天使的話這，卻沒有愛，不過如嗚的鑼，響的鈸一般。（林前十三1）有恩賜並不代表一個人就是靈性高尚，生命豐盛，就如哥林多信徒雖然口才、知識都全備，在恩賜上沒有一樣不及人的，然而保羅卻不能將他們當作屬靈的，只得把他們當作屬肉體的，在基督里為嬰孩的。（林前一5、7，三1）
有人在受聖靈洗或首次被聖靈充滿時得到某種恩賜，可能以後聖靈充滿失去了，而恩賜卻仍保留。巴蘭是墮落的先知，參孫是失敗的士師，可能還保留一個時候原有的恩賜和能力（雖然最後是完全失去了）在新約里，主耶穌曾提將來有許多人對主︰“主阿，主阿，我們不是奉的名傳道，奉你的的名趕鬼，奉你的名行許多異能麼？”主卻不承認他們，稱他們為作惡的，（太七22、23）所以不能從一個人是否有恩賜來斷定一個人的屬靈生命和與主的關系。
恩賜象受聖靈的洗一樣，可能是由使徒和長老按手而得。（徒八17，九17，十九6；提前四14）也可能聖靈直接賜給（徒二4，十44、46）按手是代表基督和教會將恩賜分給肢體，聖靈也可從作元首直接分給人。聖靈的恩賜和神的別樣恩賜都是為主作見證，並為造就教會，供應肢體的需要。（來二4；羅十二4-8；林前十二27-28；十四5、12、22；弗四7-12）若沒有恩賜，不能對教會有所供應，不能盡肢體的功用，但要緊的是連于元首，才能大得長進。（弗四15-16；西二19）
恩賜可能衰落，甚至完全失去。因此須常挑旺，（提後一6；來六4-6）因賜雖然各人所得不同，也可能一人有多樣恩賜，如彼得一樣。他有方言的恩賜，先知講道的恩賜，有信心和醫病的恩賜，有行異能和辨別諸靈的恩賜。（徒二4、14-36，三7，四8-12，五3、15）保羅也是恩賜很豐富，（羅一11，十五29；林前十四18；林後十二12）但約翰一件神跡也沒有行過，但卻是先知中最大的。（約十41；路七26）路加為主所重用卻很隱藏，那些以恩賜夸耀，自高是愚昧的，有什麼不是領受的呢？（林前四6-7）夸口的應當指著主夸口，（林前一31；耶九23-24）我們只能說，自己是無用的僕人，（路十七10）應當象保羅所說︰“我今日成了何等人，是蒙神的恩才成的。”（林前十五10）
六、聖靈的啟示
在聖靈顯著的運行和工作中，啟示也是一個重要的方面，因為有許多靈界的事和神的奧秘，以及未來的事都是人所無法知道的，所以需要聖靈的啟示，好象將幕拉開，使人看到背後的事一樣。舊約的先知是得到啟示的人，能預言到將來的事，傳講神的救恩和基督的來臨。（彼前一10-12）西面得到聖靈的啟示知道自己未死以前，必看見神所立的基督。（路二26）新約的使徒和先知都是得到特別啟示才能知道福音的奧秘，和神的永遠計劃。（弗三3-11）這些事無人能知道，只有聖靈能顯明，因為聖靈能滲透萬事，就是神深奧的事也滲透。（林前二7-12）
保羅說他所傳的福音是從耶穌基督啟示來的，不是從人領受或教導的。最大的、最中心的啟示就是啟示神兒子基督。他深深的得到了、領會了、認識了。（加一11-12、15）所以他所傳的有權威和把握，如果有人傳的與他所傳的不同要受咒詛。（加一8-9）他曾被提到三層天上去得到啟示，（林後十二1-4、7）他有重大的行動，也是要受到啟示的。（加二2）在教會中也可以得到聖靈的臨時啟示，那不是新啟示。（林前十四6、26、30）我們都可以求神將那賜人智慧和啟示的靈賞給我們，使我們真知道他。（弗一17）不過我們一般信徒所得的啟示不能越過基督和使徒的教訓和聖經所記載的只是有新的光照和看見而已。（約二9；彼後二2；猶三17；林前四6）因為啟示錄是耶穌基督的最後啟示，警告說不可再加添或刪減。（啟一1，廿一18-19）
舊約時曾有些假先知自稱得了神的默示，其實不是出于神。（耶五31，十四14，廿三25-26，廿七10）新約也有假使徒、假先知、假師傅，（太七14，廿四11；林後十一13；啟二3；約壹四1；彼後二1）起來迷惑人，決不可輕信他們，雖能行神跡奇事，也不足為憑。（申十三1-3；太廿四24）
有人自稱先知，得到了啟示，常是異端錯謬的根源。可能是他們自己也受了欺騙，也可能是故意欺騙人，他們創造新宗派，立教義，也有不少人跟從。但教義不合聖經，行為羞辱主名，憑著他們的果子，可以認出他們來。（太七20）新約時代不該有人代表神，指示神對個人的旨意。可以提出勸勉或警戒，但不能勉強人听從，各人須直接領受神的旨意，自己作出決定。（羅十四6；林前十六13）有的人喜歡作別人的先知，隨便說預言指示別人當作的事是不對的。因為新約的持點是律法放在人里面，不用別人教導說，你該認識主。因為從最小的、最大的都必認識神。（來八10-11；約十七3）
聖靈的啟示並不是常有的，每一次的啟示都是關系重大，非常清楚是出于神，內容必須完全合乎聖經真理。在得到重大啟示之後，可能要受到撒但的攻擊，象保羅似的，有一根刺加在他的肉體上，免得他過于自高。（林後十二1、7-8）人願意得啟示，卻不願意有一根刺。但這是一種屬靈的平衡，必須有所認識，為了得著啟示，有時是需要付代價的，就如但以理為明白異象，曾禱告、禁食、悲傷受苦。（但一8，二18，七15-16，八15、17、27，九3、20-21，十2、16，十八7）約翰也曾被放逐在拔摩海島上，在孤單、受難的時候，看見天開了，得著有關末後主再來的啟示。（啟一1、9）
聖靈最中心和最後的啟示，都是基督，叫我們將萬事看作有損的，唯獨以認識基督為至寶。（腓三8）別的異象都消失了，一幕一幕地都過去了，惟有剩下主在眼前，真是在天除他以外，還有誰呢？在地除他以外，也沒有所;愛慕的。（詩七三25）
七、聖靈的果子
我們每一個信主的人就是聖靈所結的果子，（羅八32；雅一18）另外，聖靈也要在我們身上結出果子來，這不是聖靈直接顯出來的，乃是借著人所彰的。然而卻是很具體、明顯、能為人所看見的，因為只有當順從聖靈和被聖靈充滿才能結出這豐滿、成熟全備的果子來。所以稱為聖靈果子，沒有聖靈的運行和工作是結不出來的，而且不是一下子就結出來的，是人常與聖靈聯合和交通的結果。好象葡萄樹的枝子與葡萄樹的關系一樣，枝子若不常在樹上就不能結果子，不常在主里面的也不能結出聖靈的果子來，結果不是方法問題，乃是生命問題，什麼樹結什麼果子。（太十二33）
聖靈的果子象聖靈的恩賜也有九樣。不過聖靈的恩賜是九樣各自不同，可以分開在不同的人身上，但聖靈的果子卻是在一棵樹上所結的，果子用單數字，表明是互相聯系，彼此一致的。雖然可以在不同的人身上，某種果子更為顯著，但不會只有一樣果子而其他完全沒有。聖靈的九樣果子就是︰仁愛、喜樂、和平、忍耐、恩慈、良善、信實、溫柔、節制。（加五22、23；弗五9；雅三17、18）
聖靈的頭一個果子是仁愛︰聖靈是有愛的。（羅十五30；西一8）因為神就是愛，他也命令我們彼此相愛。可是人自己卻沒有愛，就是有愛，也是低級的，有條件的，自私的，有目地的，惟獨從聖靈來的愛才是神那樣的愛。（林前十三4-8）
喜樂︰是聖靈同在很重要的標記。（徒十三52；羅十四17；帖前一6）這喜樂不是一時的高興快樂，由外界、肉體的感受而引起的，乃是聖靈在里面運行的結果。由于有屬天的盼望，主愛的激勵和信心的效果而大有喜樂。（彼前一6-8）甚至患難、試煉之中也能喜樂。（雅一2；彼前四13）因為里面有樂的泉源。
和平︰或作平安。不僅與人和睦，而是內心有平安。這是體貼聖靈的結果。（羅八6）一般人可能有外面的穩妥、環境的順利，然而內心卻沒有平安，里面猶如波浪翻騰，情感起伏不定，心思煩亂不寧。但聖靈在里面工作的效果是將基督的平安放在我們心里，並作主統治。（約十四27，十六33）
忍耐︰不是強忍壓抑，乃是甘心忍受，順服神的旨意，任憑人的苦待。（彼後三15；帖後三5）
恩慈︰是神所特有的。（出卅三19；亞九17；羅二4）人的恩慈是很少而苛刻的，但聖靈在人心中充滿時，人就有神的恩慈流出來了。
良善︰也只有神是。（詩八六5；可十18）聖靈能除去我們一切邪惡、不義、使心中有良善，正直，誠實。
信實、溫柔和節制︰都是聖靈的果子。沒有節制，表明聖靈在里面的工作不深，不透。人肉體的力量很強，沒有節制的人，都不是聖靈所結的果子。
讓聖靈在我們身上結出果子來，必須先治死肉體，因為兩者一直在那里相爭。如同好種撒在荊棘里是被擠住，結不出果子來的。為此，在加拉太書幾次提到與主同釘十字架的問題。（加二20，五24，六19）倘若隨從內體及其情欲，自然結出肉體的果子。（加五19-21）天然的生命不能結出聖靈的果子，主耶穌說︰“一粒麥子不落在地里死了，仍舊是一粒，若是死了，就結出許多粒來”（結十二24）必須先向下扎根，才能向上結果。（王下十九30）必須在主的死里深深扎根，將自己死透了，死絕了，同時也要在他的復活里深深的扎根，與他同活，以他為生命，完全被他所熔化，與他聯合成一靈，（羅六5；腓三10；西三3-4；林前六17）這樣才能多結果子榮耀神，並使果子長存。