从１９９３年至１９９９年，陈念聪医生和太太怀着服事的心，放弃了在香港舒适的生活和工作环境，毅然到阿富汗这个陌生而动乱的回教国家，努力学习本地的语言文化，以自身的专业帮助发展当地的医疗，负责训练本地眼科医生，制定和推广相关的训练课程。当中陈医生夫妇俩经历了无数的艰辛和危险，甚至屡次遭受枪林弹火的威胁，生命危在旦夕，但每次神都使他们逃出死亡之手，平安无恙。
陈医生的太太陈关韵韶（Wance）曾回忆说，有一次在阿富汗的寓所里，换枕头套的时候，摸到里面有一件小硬物，形状像蟑螂，当初以为那是一只死蟑螂在里面，取出来一看，却是一颗子弹头，心里为之一震，更有一种恐惧感浮上心头，
想象当时的情形，子弹从窗户外一直射到床边，最后进入这个枕头里。随即察看床边的墙壁，发现真有一个个子弹窿，顺着窗台伸延到枕边，顿时令人毛骨耸然，谁会想到在这个让人休息安眠的枕头，曾经射入子弹？不过现在已经没有这种心理阴影，因为在阿富汗这几年，这些事都时不时发生。
还有一次，他们和其它同工驾驶一辆车子，在路上被一个警察截住，陈念聪被带到警察局，他们怀疑他是外国间谍，回到机构后，同工们都急着想办法想救阿聪出来，大家知道结果恐怕是有出没回，但是Wance的心里却一点担心也没有，因为不久前神透过一个姊妹知道她她的丈夫一定会没事。
那天下午三点，陈念聪医生被关在监狱里，到了七点警卫叫他出来，到一个像会客厅的房间，很有礼貌地跟他讲话，还开电视，调到中文台。他们变得这样客气，是因为经过调查后知道他不是本地人，而是医生，于是对他的态度有三百六十度的转变，不多久，他们就让他离开了警察所。
陈念聪医生在大学一年级决志信主，人性的丑恶曾使他对生命抱着悲观的态度。信了主后，他找到了生存的意义和盼望，亦反省了自己的罪。
他说"面对这个罪恶的世界，有人采取消极的方法，比如烧炭自杀，有的透过高压的方法，要全世界都跟随。作为基督徒，每个人力量虽然有限，但如果爱心能透过每个人传开,将会对周围的世界造成非常广泛的影响。"