要说非基同盟，必须先说非基同盟所以产生的背景。简单地说，它的背景有两点值得注意的：一即新思潮的运动，一即外交上的反应。说到新思潮运动，开始于非基同盟产生前六年，这运动是由于北大的六君子发生：六君子就是陈独秀，钱玄同，沈尹墨，刘复，胡适，及周作人，这时正是蔡元培做北大校长。这运动实是中国的丈艺复兴，对于一切旧思想，旧伦理，旧制度，旧学说，皆加以价值上的重估。所以它不单是影响到中国整个的丈化，亦与基督教有莫大的关系。陈独秀所著基督教与中国人，胡适所著不朽，蔡元培所著以美育代宗教，都足以表现新思潮运动对于宗教的态度。同时，对于中国思想界发生重要影响的外国人，莫过于美国的杜威与英国的罗素两博士，他们应中国教育领袖之请，来华演讲。杜威主张实验主义，罗素主张经济的社会主义，同样对于基督教有反对的态度。杜威以宗教不当占学校课程之一部，罗素提倡男女自由同居，都是给新思想运动以莫大影响，胡适是杜威的学生，所以以实验主义做他的思想中心，处处叫人抱着『为什么』的怀疑态度。宗教是感情的产物，不能用『为什么』的理智来分析，以为凡不能以理智分析的所谓形而上部分，都是非科学的，非科学的东西，都在排斥之例，只有科学才是万能的。六个人中，影响最大而最速的，莫如陈独秀的唯物主义，胡适的实验主义，其次则钱玄同的疑古。当时青年学生界，莫不跟着他们跑：非基同盟，不可谓非新思潮运动中的一种结果。我们看他们反基的理由，大都是以马克斯的唯物史观，与信仰科学万能为出发点，后来才走到反帝国主义的路上。
第二种背景，当一九一九年欧战告终，巴黎和会的结果，激起了极大的思潮，国内的学生界以及商人，因外交上的失败，有非常激昂的舆论，对于世界各国，都笼统地表示怀疑而至于抱恨，以为非我族类，其心必异。加上五卅，大二三等惨案，觉得凡属外人，莫不是帝国主义，都是不怀好意而来的。非基同盟，又不可谓非这种民气所造成的结果。看他们非基的理由，多少带一点排外的色彩。
背景既明，然后可以说到非基同盟的事实。什么叫非基同盟？乃是基督教在中国所遭遇的第四次反对，在性质上，比第三次庚子反教来得严重，在形式及意义上却不同：
第三次第四次发动于无知识的拳匪，发动于知识阶级的学生，由一般顽旧的王公大人提倡，由几个教育家文人的领导，出发于排外思想，出发于科学思想，取野蛮的屠杀手段，取文明的文字讨论仅，限于北方的几省普及于南北各地，在物质方面尽量破坏，在思想方面尽情进攻发生流血的惨剧影响教会的改革
从这几点比较上，可以知道这次所谓非基同盟，是一回什么事。我们且先来看一看非基同盟的产生：
当一九二二年世界基督教学生同盟。开十一届大会于中国。我国以地主的地位，借北京『清华大学』为招待三十余国代表的会场。自四月四日下午开会，至八日晚间闭会。舆会代表，计外国一百四十六人，我国各省区出席代表有四百余人，大都是全世界学生界领袖，其问有著名的文学家著作家。美国穆德博士为该会会长，我国如王正廷余日章等皆为该会中坚。会中分六股讨论：(一)国际与种族问题，(二)基督教与社会及实业界之改造，(三)如何宣传基督教于现代学生，(四)学校生活之基督化，(五)学生在教会中之责任，(六)如何使世界基督教学生同盟会在世界中成一更强有力之团体。此外有霍德进演说『基督教与国际』，法代表蒙博士演说『基督教与平民运动』，德国某哲学家演讲『基督教与哲学』，丹麦学生代表演讲『基督教与实业』，巴黎大学某博士演讲『基督教与文化』等等。这原不过是一种寻常的宗教聚会，并没有别的意义，却不料会引起非基会徒学生的反对。他们一听见四月间有这样一个聚会，不问这个聚会的性质如何？便在三月间就发动起反对来，三月九日发出一篇宣言，叫做非基督教学生同盟宣言。
该宣言，是以社会主义为立场，硬说基督教是资本主义的先锋，把这次世界基督教学生同盟大会，看做是资本主义支配经济的会议，我们一看前面所述大会中的议题，便可知道这种反对完全是误会的。次日又发了一个通电(即灰电)其意义与宣言不同，侧重在『清华乃国校，不能供一教之用』。隔了七日，又有非宗教大同盟的霰电及宣言。灰电没有发电地点及负责人名，霰电却说明是北京各学校并有『北京大学第一院金家凤收交』字样，又有七十七人签名有名单。其宣言则称为非宗教，内容还是非基督教，特别痛骂青年会。同是对基督教的攻击，不过立场不同，而以基督教为违反科学，束缚思想，麻醉青年的毒物。中间有几句极决绝的话，『有宗教可无人类，有人类应无宗教，宗教与人类不能两立』。是欲把宗教从人类社会中扫除，也就是要把基督教从人类社会中扫除。这两次宣言发表以后，便引起全国学生界响应，于是函电纷驰，对于教会不无仇视。
在基督教方面，能够出来与他们辩驳的，却是很少，只有真光杂志的记者张亦镜氏，可算是唯一努力的健将，他在真光杂志上差不多每期都有辩驳的文章，后来他把这些丈章印成一册，叫批评非基督教言论汇刊。他那种孤军奋战的精神，也给非基督教人们的一个反攻。另外有许多基督徒作家，对于非基督教的言论，却相当地容纳了一部份意见，指出基督教内部的缺点，发表了许多自省的文章，如：徐宝谦的反对基督教运动与吾人今后应采之方针：赵紫宸的风潮奋起的中国教会，武汉基督**革新运动宣言等等，大都是对内的言论，而于非基督教的言论，认为不屑与辩的。倒有几个第三者出来评论其是非，最初有周作人等五人，『在非宗教同盟』霰电发表以后，接着就发表一篇宣言：
『我们不是任何宗教的信徒，我们不拥护任何宗教，也不赞成挑战的反对任何宗教。我们认为人们的信仰应该有绝对的自由，不受任何人的干涉，除去法律的制裁以外，信教自由，载在约法，知识阶级的人，应首先遵守，至少也不应首先破坏，我们因此对于现在非基督教非宗教同盟的运动，表示反对，特此宣言。周作人钱玄同沈兼士沈士远马裕藻三月三十一日。』
这是第三者根据信教自由的立场，来反对非基同盟。意思就是说，强迫人信某种宗教是违反信教自由，强迫人不信某种宗教也是违反信教自由，非基同盟就是犯了后者的毛病。这的确给予非基的学生们一盆冷水，所以在东电里表示对五人电报的不满意，他们说：『对于现在的非基督教非宗教同盟的运动表示反对，而对于耶教学生同盟，又独不表示反对，虽说他们「不拥护任何宗教」其实已经有倾向于拥护宗教的嫌疑，而失了完全的中立态度』。这见得非宗教同盟的无聊解嘲，因为这句问话，很容易解答的，假使他们要回答的话，只要说『耶教学生同盟，并没有干涉到非耶教人的自由』！一看这电报，就会懂得有这句话在里头，所以我说东电里的驳语是无聊的。
梁启超也以第三者来说几句折衷的话，其实也是对『非宗教同盟』的一个忠告。梁先生本来惯于说两面光的话，他在四月十大那一天在『哲学社』公开演讲，题目就叫评非宗教同盟，他替宗教下了个定义，说一切信仰都是宗教，证明非宗教的不可能。他说：『我在我所下的宗教定义之下，认宗教是神圣，认宗教为人类社会有益且必要的物事，所以我自己彻头彻尾承认自己是个非非宗教者』。这个意思，明明是驳他们『宗教与人类不能两立』的话。他所下的宗教定义，果然太嫌笼统，但是对非宗教同盟者的武断态度，的确是一种针砭。常乃德也写了一篇对于非宗教同盟的诤言，他以为『非宗教同盟』的人，还没有把问题弄清楚，自己以为拥护科学，却不知不觉有『武断』『谩骂』『凶暴』等非科学的气焰。他说：『英国美国是基督教国，但他们的科学进步，比非基督教的中国，究竟谁好谁坏？』他竟举出了三十二条不解，说他们不能平心静气地加以研究。这也是对于那班非宗教的学生们一番不客气的教训。陈卫哲在努力周报上写了一篇基督教在欧洲历史上的位置，从历史研究的立场，说了一番持平话。另外有一位旁观者叫刘绍宽，他却没有像上面几个人那样客气了，竟说：
『深叹非基督教一般人全无学识，盲言瞎论，亡中国者必此辈人也。此辈自认为科学中人，而科学家如歌白尼奈端侯失勒诸人，皆是基督教中人，彼竟不知今乃于新旧约全未见，凡新约中所主张真平等真自由，及力破资本主义处，全未知之，反谓诱人欢迎资本主义，要养成资本家的走狗，真是梦话。至谓我国本无宗教，又云有宗教可无人类，有人类应无宗教，宗教与人类不能两立等语，更是无法无天之极独恨中国学子，全是盲从，胸无点墨，如汪精卫等，自命通人，而所言鄙俗尚如是，他更安足言耶？徒借盲言瞎论，叫嚣一世，以自文其不学无行之罪状。而祸害一世，不可救药矣。』
这正如老师痛斥顽皮学生一样的严厉，便成为斩断乱丝的快刀。
溯自民国成立以来，对于保障信教自由，教会会经有过相当的努力，当时有人主张规定孔教为国教，全国基督徒结合团体，并会同其他宗教，起而与争，奔走呼号，派代表赴北京请愿，并主持其事，幸而能获得信教自由的条文规定：此次的反教，显然有背于信教自由的原则，是以那班局外的学者作此不平之鸣，使这次普遍的反教运动，渐渐地无形消灭。虽然这一次的反教，仅仅是一场笔墨官司，但却给予了基督教不少刺激：能使一般基督徒在精神上在思想上自己加一番检讨，觉悟到自身确有其不可或讳的弱点。同时，觉得要消除外界的误会，使基督教从不平等条约的关系中解放出来，惟有使中国教会脱离西洋化而为中国化。于是有中国『本色教会』的运动。
何谓『本色教会』？解释的人很多，简单地说：就是一个自理自养自传的中国化教会。这个运动，是从『基督教协进会』提倡起来的。诚诤怡氏曾经说：
『当今举国皆闻的「本色教会」四字，也是「协进会」所提倡。一方面求使中国信徒担负责任，一方面发扬东方固有的文明，使基督教消除洋教的丑号』。(见真光杂志二十五周纪念特刊协进会对于教会之贡献)
在这短短的几句语里，很明白地指出『本色教会』的任务与目的。任务有两种．一使中国信徒自负责任。这责任就是自理自养自传，在经济上行政上工作上，都是以中国信徒为主体，西国教士可以退处于辅佐地位。虽不免有少数西人怀疑到是一种排外的举动，但是大多数贤明的西教士，都十分同情，协助这运动的进行。因为中国教会真正能达到自理自养自传，可以减轻了西教士的负担，所以在很早就有人在提倡，像俞国桢氏所创立的『中国自立会』(自立会有两种：一称中国耶稣教自立会，一称中华基督教自立会，成立有六百余处，散布在河北河南湖北四川淅江江苏山东福建广东等省)与胡素贞女士所发起的『国内布道会』，皆其一例。另一任务是发扬东方固有的文明。那就是要使教会与中国文化结婚，洗刷去西洋色彩。这在当时便有人主张改变礼拜仪式，采取一点佛教的方法，在礼拜时燃点香烛，跪诵以文祷文等等，上海在宝兴路曾有过这样一种试验、在南京艾香德氏所组织的『景风山』，完全变成了佛化基督教。同时，也有从诗歌方面入手，特著了许多中国歌调的赞美诗，一方面也修改固有的赞美诗，使诗歌中国化起来。但是这种形式上的改变，不独不足以适合本色教会的原意，却反而觉得愈加纷歧，所以有人主张从思想方面来研究，一方而研究中国文化是什么，一方而研究基督思想如何与它调和。基督教学者曾发表了许多意见，基督教与中国文化一类的文章，在教会杂志上层见叠出。吴雷川氏曾著成了一专书，——基督教与中国文化——他如徐宝谦赵紫宸谢扶雅等都著作过这类的文字，这些大概是从建设方而着想的。另外有从破坏方面着想的，像聂云台主张『基督教儒教化』，张纯一主张『基督教佛教化』，他们的言论，虽然离开了根本的立场，几乎站在反对的地位，但是他们不满意于基督教的西洋色彩，是相同的。我们看一看『基督教全国大会』里所发表的教会的宣言第二段，举出九条关于『本色教会』的意见，其间第三第六第七条说：『三，我们对于西来的古传，仪式，组织，倘若不事批评，专做大体的抄袭，卑鄙的摹仿，实在是不利于「中华基督教」永久实在的建设，这是我们教会同胞的公意。』『六，所以我们请求国内耶稣基督的门徒，通力合作。用有系统的捐输，达到自养的目的。由果决的实习，不怕试验，不惧失败，而达到自治的正鹄。更由充分的宗教教育，领袖的栽培，及挚切的个人传道，而达到自传的目的。』『七，我们宣告时期已到，吾中华信徒，应用谨慎的研究，放胆的试验，自己删定教会的礼节和仪式，教会的组织和系统，以及教会布道及推广的方法。务求一切都能辅导现在的教会，成为中国本色的教会。』
这确可代表一般中国基督**要说的话，西国人也有很多是同意的，欧德模氏发表过这样几句话，也可以代表一般西国人的意见：
『中国教会本色的问题，是「协进会」的必需比如尝有苏格兰的友人警告我说，我应当时刻小心，不要过于推重美国人的思想，或是习染美国人的方法。因为这种美国色彩的东西，决不合苏格兰的民情。同时，我也看得出来，若是一种办事的方法，过于带英国的色彩，又不是美国人的利益，同时欧陆各国的友人，也要发生一样的感觉到什么时候基督教才有真确的本色有发扬呢？就是什么时候基督教的运动，是本国人亲手来主持他，管理他，必要他们自身去取决行止，那就是那一国的基督教自由发展了若是基督教必需按着本国的国情自由发展，那个问题的答复，不只是由中国人自行决断，乃是中国人要自身去发生一个自动的问题中国人到底是否要自动的担负完全责任？依鄙人看来，一种带西洋色彩的责任，中国人还未心愿意去负担他。』(上皆见全国大会纪录)
这样，可以见得无论中西人士，一致承认中国教会必须脱离西洋色彩，就是上面所说『要消除洋教的丑恶』，这便成为提倡『本色教会』的目的，而使基督教完全成为中国的基督教。